Re: Nukleofilowość...

Dzięki za wyjaśnienia...
NIestety nie jestem ostatecznie ukontentowany odpowiedzią. Oczywiście jest
to winą nie pełnego przedstawienia problemu z mojej strony. Pracuję nad
przyłączaniem oligonukleotydów do podłoża CPG modyfikowanego gr aminowymi. I
etap to aktywacja podłoża chlorkiem mesylu. I na tym etapie sformułowałem
pytanie, mieszanina aktywująca to chlorek mesylu+pirydyna vel TEA. w
pierwszym przypadku istnieje ryzyko że w jednym etapie zachodzi i aktywacja
i dezaktywacja podłoża gdyż po reakcji podłoża aminowego z MeCl pirydyna
atakuje węgiel alfa do grupy aminowej podłoża uwalniając sulfonamid(Sn2).
Mówi się generalnie że pirydyna jest bardziej nukleofilowa niż TEA ale to
właśnie z TEA reakcja zachodzi tak gwałtownie, czy może się mylę?

----- Original Message -----
From: "Witek Mozga" <mozga@trimen.pl>
To: "Chemia popularnonaukowa." <chemfan@man.lodz.pl>
Sent: Tuesday, September 02, 2008 9:14 AM
Subject: Re: Nukleofilowość...

>
>> Z przebiegu reakcji wnioskuję że TEA jest
>> silniejszym nukleofilem niż pirydyna, czy tak jest naprawdę, gdzieś w
>> literaturze znalazłem wręcz odwrotną zależność, mianowicie że TEA jest
>> mniej nukleofilowa niż pirydyna.
>
> Nie bardzo wiem o jakiej reakcji piszesz, że zaszła bardzo gwałtownie. Czy
> między podłożem i MsCl czy miedzy Et3N i MsCl? Prawdę mówiąc nie wiem czy
> Et3N reaguje z samym Ms-Cl (być może z eliminacją HCl i utworzeniem
> sulfenu z
> wiązaniem C=S?)
>
> Co do nukleofilowości, to rzeczywiście pirydyna może być lepszym
> nukleofilem w
> niektórych reakcjach, gdyż zawiera dużo ruchliwych elektronów w
> pierścieniu
> aromatycznym i ma mocno odsłoniętą wolną parę elektronową. Jednak Tobie
> zapewne chodzi nie o nukleofilowość lecz o zasadowość. Tutaj bez wątpienia
> Et3N jest mocniejsza kilka rzędów od pirydyny. Tobie nie chodzi przecież o
> to, żeby reagowała pirydyna czy Et3N, lecz podłoże. Amina którą dodajesz
> służy do łapania wydzielającego się HCl, który deaktywowałby grupy aminowe
> podłoża. Dlatego musi być ona przede wszystki zasadowa a niekoniecznie
> nukleofilowa.
>
>
> --
> Witek Mozga
> http://trimen.pl
> http://advamacs.com
>
Received on Tue Sep 2 18:00:57 2008