O tej liście Wg daty Wg wątków Wg tematów Wg autorów Wg załączników

Autor: Maciej Haranczyk (maharan_at_chem.univ.gda.pl)
Data: Thu 25 Mar 2004 - 23:06:33 MET


> > Witam, wlasnie rozpoczynam prace z Gaussianem. Nie za bardzo wiem od czego
> >zaczac, satd moja prosba: czy ktos moglby mi pomoc w skonstruowaniu macierzy
> >Z np dla metanu? Ew. komentarz mile widziany
> >
> >
> witam oto przyk?ad:
>
>
> C 00000.0000 0 00000.0000 0 00000.0000 0 0 0 0
> H 00001.0900 1 00000.0000 0 00000.0000 0 1 0 0
> H 00001.0899 1 00109.4710 1 00000.0000 0 1 2 0
> H 00001.0900 1 00109.4709 1 00119.9994 1 1 2 3
> H 00001.0900 1 00109.4714 1 00239.9997 1 1 2 3

Ten przyklad nie jest najlepszy.
Po pierwsze to jest z-matrix w formacie mopac'a, nie gaussiana. Po drugie nie uwzglednia symetrii.

Z-matrix, ktora bedzie dobrze dzialac w gaussianie to np:

 c
 h 1 hc 

 h   1 hc        2 hch
 h   1 hc        2 hch         3 dih
 h   1 hc        2 hch         3 -dih

hc         1.089000

hch        109.471
dih        120.000

Zauwaz, ze miedzy linia opisujaca dlugosc wiazania hc i katem hch jest linia przerwy. Pierwszy blok (linia hc) okresla zmienne a drugi blok (hch i dih) okresla stale. Gdy bedziesz optymalizowal ten uklad - musisz pamietac aby dodac opcje opt=(z-matrix), w innym wypadku gaussian nie bedzie respektowal stalych.

Zwroc uwage, ze tak przygotowana czasteczka metanu ma prawidlowa grupe symetrii Td. Poszukaj w outpucie: 

 Full point group                 TD      NOp  24
 Largest Abelian subgroup         D2      NOp   4
 Largest concise Abelian subgroup D2      NOp   4

Pozdrawiam, Maciek 

-- 

 Maciek Haranczyk
 maharan_at_chem.univ.gda.pl
O tej liście Wg daty Wg wątków Wg tematów Wg autorów Wg załączników

To archiwum zostało wygenerowane przez hypermail 2.1.7 : Thu 25 Mar 2004 - 23:12:11 MET